Protein–RNA interactions for Protein: P16381

D1Pas1, Putative ATP-dependent RNA helicase Pl10, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D1Pas1P16381 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
D1Pas1P16381 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
D1Pas1P16381 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
D1Pas1P16381 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
D1Pas1P16381 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
D1Pas1P16381 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
D1Pas1P16381 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
D1Pas1P16381 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
D1Pas1P16381 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms