Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim30aP15533 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim30aP15533 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim30aP15533 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim30aP15533 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms