Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fgf4P11403 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf4P11403 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fgf4P11403 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms