Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Amd1P0DMN7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Amd1P0DMN7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Amd1P0DMN7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms