Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxb2P0C1T1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxb2P0C1T1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxb2P0C1T1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms