Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxb5P09079 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb5P09079 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxb5P09079 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms