Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxa5P09021 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxa5P09021 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxa5P09021 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms