Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn3P06796 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn3P06796 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn3P06796 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csn3P06796 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csn3P06796 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csn3P06796 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn3P06796 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn3P06796 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csn3P06796 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csn3P06796 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csn3P06796 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms