Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P06320 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P06320 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P06320 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P06320 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P06320 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P06320 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P06320 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P06320 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P06320 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P06320 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P06320 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P06320 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P06320 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P06320 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P06320 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P06320 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P06320 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P06320 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P06320 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P06320 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P06320 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P06320 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P06320 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06320 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06320 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06320 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
P06320 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P06320 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P06320 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06320 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06320 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06320 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06320 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06320 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06320 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P06320 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P06320 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06320 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06320 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06320 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06320 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06320 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06320 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06320 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06320 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P06320 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06320 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06320 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06320 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06320 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P06320 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P06320 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06320 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06320 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06320 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06320 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P06320 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06320 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06320 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06320 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P06320 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06320 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06320 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06320 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06320 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06320 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06320 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06320 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06320 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P06320 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P06320 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P06320 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P06320 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06320 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06320 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06320 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06320 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06320 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06320 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06320 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms