Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01668 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01668 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01668 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01668 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01668 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01668 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01668 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01668 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01668 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01668 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01668 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01668 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01668 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01668 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
P01668 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01668 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01668 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01668 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01668 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01668 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01668 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01668 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01668 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01668 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01668 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01668 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01668 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01668 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01668 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01668 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01668 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01668 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01668 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01668 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01668 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01668 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01668 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01668 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01668 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01668 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P01668 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01668 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01668 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01668 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01668 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01668 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01668 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01668 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01668 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01668 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01668 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01668 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01668 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01668 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01668 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01668 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01668 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01668 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01668 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P01668 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01668 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01668 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01668 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01668 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01668 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01668 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P01668 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01668 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01668 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
P01668 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01668 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01668 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01668 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01668 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
P01668 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01668 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01668 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P01668 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
P01668 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01668 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01668 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01668 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01668 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01668 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01668 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01668 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P01668 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01668 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01668 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P01668 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms