Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tcn2O88968 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tcn2O88968 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcn2O88968 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcn2O88968 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms