Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb2O55029 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copb2O55029 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copb2O55029 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Copb2O55029 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Copb2O55029 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Copb2O55029 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Copb2O55029 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms