Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dkk1O54908 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dkk1O54908 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms