Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk2a2O54833 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk2a2O54833 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk2a2O54833 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms