Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccl25O35903 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccl25O35903 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl25O35903 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl25O35903 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl25O35903 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl25O35903 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl25O35903 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccl25O35903 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms