Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
H2-ObO35424 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
H2-ObO35424 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
H2-ObO35424 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms