Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E5

Vmn2r39, Vomeronasal 2, receptor 39, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r39L7N2E5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r39L7N2E5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn2r39L7N2E5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r39L7N2E5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn2r39L7N2E5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r39L7N2E5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms