Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vwa3bJ9JI28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vwa3bJ9JI28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vwa3bJ9JI28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vwa3bJ9JI28 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms