Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gm379J3QQ19 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm379J3QQ19 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm379J3QQ19 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm379J3QQ19 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms