Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8356J3QPD3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8356J3QPD3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8356J3QPD3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms