Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem200cJ3QK46 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem200cJ3QK46 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms