Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21897J3KMP5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21897J3KMP5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21897J3KMP5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms