Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Pot1bH7BX60 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pot1bH7BX60 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms