Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc4lG5E8X2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pabpc4lG5E8X2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pabpc4lG5E8X2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pabpc4lG5E8X2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms