Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NpcdF8VQB8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NpcdF8VQB8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NpcdF8VQB8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NpcdF8VQB8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms