Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdh9F8VPK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdh9F8VPK8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdh9F8VPK8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms