Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Ttc37F8VPK0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ttc37F8VPK0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ttc37F8VPK0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ttc37F8VPK0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ttc37F8VPK0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms