Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm8220F6YKI2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm8220F6YKI2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8220F6YKI2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8220F6YKI2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms