Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm8444F6XS56 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm8444F6XS56 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm8444F6XS56 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8444F6XS56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8444F6XS56 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8444F6XS56 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm8444F6XS56 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms