Protein–RNA interactions for Protein: F6TUL9

Vsig4, V-set and immunoglobulin domain-containing 4, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig4F6TUL9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vsig4F6TUL9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig4F6TUL9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsig4F6TUL9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms