Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf212F6TQD1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf212F6TQD1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf212F6TQD1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms