Protein–RNA interactions for Protein: F6TNE3

Prr22, Proline-rich 22, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr22F6TNE3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr22F6TNE3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr22F6TNE3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr22F6TNE3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr22F6TNE3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr22F6TNE3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr22F6TNE3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prr22F6TNE3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prr22F6TNE3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prr22F6TNE3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr22F6TNE3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prr22F6TNE3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms