Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc141E9Q8Q6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc141E9Q8Q6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Ccdc141E9Q8Q6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Ccdc141E9Q8Q6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc141E9Q8Q6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ccdc141E9Q8Q6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms