Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Urb2E9Q7L1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Urb2E9Q7L1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Urb2E9Q7L1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Urb2E9Q7L1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms