Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm20518E9Q548 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm20518E9Q548 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms