Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm17175E9Q528 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm17175E9Q528 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm17175E9Q528 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms