Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Speer4f2E9Q366 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Speer4f2E9Q366 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f2E9Q366 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms