Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hectd4E9Q2E4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hectd4E9Q2E4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hectd4E9Q2E4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms