Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8237E9Q257 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm8237E9Q257 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8237E9Q257 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms