Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Chd2E9PZM4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Chd2E9PZM4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chd2E9PZM4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chd2E9PZM4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Chd2E9PZM4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Chd2E9PZM4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms