Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gimd1E9PW74 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gimd1E9PW74 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gimd1E9PW74 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gimd1E9PW74 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gimd1E9PW74 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gimd1E9PW74 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gimd1E9PW74 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gimd1E9PW74 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gimd1E9PW74 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gimd1E9PW74 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gimd1E9PW74 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gimd1E9PW74 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms