Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc17E9PVB5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc17E9PVB5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc17E9PVB5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms