Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3252E9PUT9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3252E9PUT9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm3252E9PUT9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm3252E9PUT9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3252E9PUT9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3252E9PUT9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms