Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vpreb3D3Z6J4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vpreb3D3Z6J4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb3D3Z6J4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.1 ms