Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms