Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kif28pD3YXS5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kif28pD3YXS5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kif28pD3YXS5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms