Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nlrc5C3VPR6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nlrc5C3VPR6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nlrc5C3VPR6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nlrc5C3VPR6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms