Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna7C0LLJ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna7C0LLJ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms