Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ptprz1B9EKR1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ptprz1B9EKR1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms