Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CatipB9EKE5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CatipB9EKE5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CatipB9EKE5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CatipB9EKE5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CatipB9EKE5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CatipB9EKE5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CatipB9EKE5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CatipB9EKE5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CatipB9EKE5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CatipB9EKE5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CatipB9EKE5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms